RSUD Mappi mulai ditetapkan sebagai RS Persiapan pada tahun 2004. Sampai sekarang RSUD Mappi menempati lokasi dan bangunan yang tadinya Puskesmas rawat inap Kepi. Bangunan – bangunan baru pun ditambah, antara lain ruang rawat inap dengan kapasitas 8 tempat tidur.